Hanno usi diversi. La tabella delle partizioni GUID (GOT) è lo schema usato dai server, dai Mac e da molti PC Windows contemporanei. MacOS su Intel si avvierà solo da un disco con una tabella di partizione GUID, e i sistemi Windows dal 2005 in poi possono leggere/scrivere questi dischi ma possono avviarsi da essi solo su sistemi con UEFI (invece di un BIOS).
Apple Partition Map era uno schema usato dai Mac Motorola 680x0 e PowerPC prima del 2006. Quei vecchi sistemi possono solo avviarsi da dischi partizionati APM, e non potevano leggere dischi partizionati GPT.
MBR È il più vecchio dei 3, introdotto come parte del PC-DOS nel 1983. Da allora è stato lo standard per i computer della piattaforma "Wintel". I moderni PC Windows usano ancora uno schema di partizionamento MBR perché Windows supporta solo l'avvio da GPT su sistemi con UEFI. Sempre più sistemi Windows stanno comparendo con UEFI, e le versioni moderne di Windows possono leggere dischi partizionati GPT, quindi GPT sta diventando mainstream anche per i sistemi Windows.
Si dovrebbero formattare i dischi con tabelle di partizione GUID. Per i dischi di avvio di macOS, è obbligatorio. Per gli altri dischi è preferibile GPT, a meno che il disco non venga usato come disco di avvio per i Mac precedenti al 2006, nel qual caso APM è obbligatorio. Se il disco deve essere usato come disco di avvio di Windows per sistemi non-UEFI, usato con computer o sistemi operativi precedenti a GPT (2005), o usato per la memorizzazione in un dispositivo (come una telecamera, un decoder satellitare, ecc.) che richiede lo schema di partizione MBR, allora usate lo schema MBR.