Penso che sia troppo presto per sapere chi potrebbe accettare Apple Pay per i pagamenti, a parte Apple ovviamente. Anche se, tenete a mente che Amazon non accetta nemmeno Paypal, un sistema di pagamento molto più affermato e maturo di Apple Pay. Tuttavia, è garantito che i luoghi che hanno già i loro sistemi di pagamento come Amazon, saranno sempre prevenuti verso l'uso del loro sistema rispetto all'accettazione di Apple Pay. Quello che probabilmente troverete è che, come Paypal, avrete bisogno di comprare carte regalo Amazon attraverso Paypal (e possibilmente Apple Pay) e poi applicare le carte al vostro account Amazon per comprare effettivamente qualcosa su Amazon. Se le cose rimangono costanti però... proprio come Paypal, Amazon potrebbe non accettare mai Apple Pay.
Apple dovrà mostrare qualcosa di impressionante e unico al loro sistema di pagamento rispetto, per esempio, a Square per far sì che i commercianti lo accettino e lo adottino e i consumatori lo abbraccino. Per ora, sono solo in modalità aspetta e vedi. A meno che Apple Pay sia sostanzialmente più facile e/o più sicuro dell'uso di una carta, non sono necessariamente incline ad usarlo (a parte forse quando faccio acquisti all'Apple Store... cosa che faccio raramente).
Siccome hai chiarito la tua domanda per includere le app iOS e i siti mobili di Amazon, chiarirò anche questa risposta ulteriormente. Non è ancora chiaro se accettare Apple Pay all'interno di un'app iOS costituisca un 'pagamento in-app'. L'intera ragione per cui Amazon ha scelto di non utilizzare pagamenti in-app all'interno delle sue app iOS (cioè, app Kindle) è dovuta alla tassa di transazione del 30% di Apple richiesta per utilizzare il sistema di pagamento in-app. È probabile che Apple Pay avrà una struttura di commissioni simile. Di conseguenza, nessuna delle app iOS di Amazon offre attualmente pagamenti in-app per gli acquisti di Amazon. È necessario visitare un sito Amazon e acquistare direttamente da quel sito Amazon. Le app possono poi scaricare e utilizzare il contenuto che avete pagato al di fuori dell'app. È altamente improbabile che questa struttura a pagamento cambi molto utilizzando Apple Pay. Quindi, a meno che Apple non scelga di eliminare il 30% di ogni acquisto in-app (non è probabile), Amazon continuerà molto probabilmente a usare i propri sistemi di pagamento al di fuori delle sue app iOS per evitare questo addebito.