Come suggerito da Raja Ram M, ho intenzione di postare una "soluzione" al problema in modo da assistere altri in futuro che potrebbero avere un problema simile.
Si prega di notare che questo problema è legato agli interrupt di sistema, e quindi può avere diverse cause potenziali. Non sono nemmeno sicuro di aver effettivamente risolto il mio problema, ma fornirò comunque una soluzione, così forse sarà utile ad altri.
Ogni volta che si verifica un improvviso ritardo nelle prestazioni, la prima cosa da fare è controllare il processo in Task Manager (tipicamente Ctrl + Shift + Esc).
Se notate che gli interrupt di sistema sono insolitamente alti, allora c'è una buona possibilità che possiate avere problemi hardware, come i driver, che stanno causando questo insolito aumento nell'utilizzo della CPU.
Stavo eseguendo una scansione di virus durante lo screenshot, quindi il processo ESET, ma è tipico per il software antivirus consumare grandi quantità di utilizzo della CPU - ciò che non è normale, tuttavia, è la quantità di utilizzo che gli interrupt di sistema stanno utilizzando. Se gli interrupt di sistema stanno consumando più del 5-10% dell'utilizzo della CPU, allora potrebbe esserci un problema (gli interrupt di sistema stavano consumando un quarto del mio utilizzo della CPU, e hanno consumato fino al 40% durante il movimento del mouse - una quantità molto significativa).
Gli interrupt di sistema sono fondamentalmente messaggi che avvengono tra il computer e altri hardware, come i dispositivi USB. Se sospettate di avere problemi legati agli interrupt di sistema, allora dovreste scaricare Windows Performance Analyzer e usare il prompt dei comandi per eseguire xperf e tracciare le prestazioni del vostro sistema, in particolare quando inizia il ritardo (notate che questo è per Microsoft Windows 8/8.1).
A seconda della causa, avrete una varietà di soluzioni, che vanno dalla disinstallazione o l'aggiornamento di un driver alla possibile sostituzione dell'hardware.