Quando Atlassian ha iniziato a sviluppare Jira, lo ha sviluppato per essere uno strumento di monitoraggio dei problemi. Nel corso degli anni, quando la gente ha voluto estendere le funzionalità di Jira, è diventato uno strumento di gestione dei progetti.
Jira è stato usato come uno strumento di gestione dei progetti. Nel corso degli anni, quando la gente ha voluto utilizzare il modo Agile di gestire le cose, uno dei fornitori ha sviluppato un plugin chiamato come Greenhopper plugin per Jira. Il plugin ha permesso agli utenti di creare progetti Agile e di mantenerli. Dopo qualche tempo, Atlassian acquisì il plugin e lo rinominò come Jira Agile plugin per Jira. Più tardi il plugin è stato fuso con Jira e così è nato Jira Software. La Jira senza Jira Agile è Jira Core.
La differenza principale tra Jira Core e Jira Software è che Jira Software (in Scrum o Kanban) permette alle persone di usare Jira in modo Agile mentre Jira Core è senza modo Agile. L'uso di Jira Software fornisce anche i rapporti che sono associati con le metodologie Agili.
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