Dipende dal malware. La riformattazione rimuoverà la maggior parte del malware, ma ci sono eccezioni. Assicuratevi solo di eliminare la partizione di ripristino e di installare da un supporto noto.
Alcuni malware possono modificare il BIOS o altre parti del computer che sopravviveranno a una riformattazione del disco rigido. Questo tipo di malware è raro perché è specifico per l'hardware. Un attaccante dovrà sviluppare una variante per ogni modello di disco rigido o di scheda madre che vuole prendere di mira. A volte anche lo stesso modello ha differenze non documentate che richiedono ancora più varianti di malware.
Questo è un livello di sofisticazione e di sforzo che gli attaccanti della varietà da giardino fortunatamente non hanno ancora raggiunto. Questo è il regno degli aggressori e dei ricercatori degli stati nazionali. C'è stato un malware di ricerca descritto pubblicamente che prende di mira un singolo modello di hardware.
Tuttavia, c'è anche un malware in libertà che può scriversi su una partizione di ripristino. La maggior parte dei produttori di personal computer partizionano i dischi rigidi con una piccola partizione nascosta che contiene i file essenziali di Windows. In questo modo, risparmiano qualche dollaro perché non hanno bisogno di spedire dischi OEM di Windows. La riformattazione non rimuoverà necessariamente la partizione di ripristino, e si potrebbe reinstallare il malware a meno che non si rimuova la partizione di ripristino e si reinstalli da un supporto separato che si sa essere pulito.