L'aggiornamento a una nuova versione di iOS sblocca il tuo dispositivo, quindi devi aggiornare, ri-jailbreak, e poi reinstallare i tuoi pacchetti Cydia (tweaks/temi/ecc.) dopo l'aggiornamento.
Quindi il tuo primo passo è scrivere i nomi di tutti i pacchetti Cydia che hai installato (andando in Gestione → Pacchetti) o usare uno dei pacchetti di backup disponibili -- AptBackup è gratuito e minimalista (registra e poi può ripristinare una lista dei tuoi pacchetti installati) e PkgBackup è 8 dollari e un po' confusionario ma più completo (fa il backup dei dati del jailbreak). Ci sono anche xBackup e alcuni altri pacchetti che non ho ancora testato. Io tendo ad usare AptBackup.
Il tuo prossimo passo è quello di collegarti ad iTunes, premere Restore, accettare il backup e aggiornare all'ultima versione. Poi fai di nuovo il jailbreak (queste guide sono decenti: http://www.iclarified.com/jailbreak/), vai su Cydia e installa AptBackup (se è quello che hai usato per fare il backup della tua lista di pacchetti), e poi usa AptBackup per reinstallare il resto delle tue modifiche -- e poi riconfiguralo come preferisci. Puoi anche sempre andare su Manage Account (nella homepage dell'app Cydia), accedere al tuo account, toccare Installable Purchases, e reinstallare i tuoi pacchetti a pagamento da lì. Woo!