Sì - c'è una differenza, ma non è grande. Linux Mint basa la sua distribuzione su Ubuntu, e per lo più, utilizza i pacchetti dai repository dei pacchetti di Ubuntu. Differisce principalmente nella sua interfaccia utente: Mint fornisce alcuni pacchetti extra per renderla, beh... menta. Questi pacchetti vivono su
Repository - Linux Mint
per Mint 18.3, e includono l'ambiente desktop Cinnamon (che è disponibile anche in Ubuntu), pacchetti UI a tema Mint, oltre a strumenti di backup e gestione dei pacchetti specifici di Mint. A parte questi pacchetti, Ubuntu e Mint usano gli _esatti_ repository dei pacchetti. In realtà è abbastanza possibile prendere un'installazione di Ubuntu vanilla e poi convertirla a Linux Mint aggiungendo il repository Mint a /etc/apt/sources.list o /etc/apt/sources.list.d/, quindi installando i pacchetti specifici di Mint.
In realtà faccio qualcosa di simile con Debian e Linux Mint: Installo Debian Linux vanilla, poi installo manualmente il pacchetto mintupdate e le sue dipendenze. Per me, mintupdate è davvero la caratteristica che rende Mint facile da usare.